實驗動物房屬于生物潔凈室，但由于它本身的特點，其潔凈度標(biāo)準(zhǔn)不宜直接套用美國航空航天局標(biāo)準(zhǔn)所規(guī)定的潔凈室分級標(biāo)準(zhǔn)其主要原因如下:
（1）NASA《潔凈室和潔凈工作臺微生物的控制標(biāo)準(zhǔn)》，是為宇宙飛船的制造、試驗和發(fā)射環(huán)境而制定的潔凈室標(biāo)準(zhǔn)。其主要目的之一是極力避免地球上的物質(zhì)、微生物等混來自其他星球的采樣中，以防止對其他星球是否存在某種物質(zhì)或微生物的錯誤判斷。此外還要防止從其他星球的采樣中攜帶回的，可能危及人類地球安全的未知物質(zhì)和微生物的擴(kuò)散、傳播。所以，該標(biāo)準(zhǔn)是比較嚴(yán)格的。但實際上NASA標(biāo)準(zhǔn)從發(fā)表迄今不僅被用于世界各國的宇航工業(yè)，而且還被引用于醫(yī)藥工業(yè)、食品工業(yè)、生物實驗室以及醫(yī)學(xué)等各種微生物凈化領(lǐng)域。不過，醫(yī)學(xué)界認(rèn)為該標(biāo)準(zhǔn)對于某些不必嚴(yán)格排除非生物性微粒的使用部門增加了額外的制約，況且就對微生物粒子的控制而言，該標(biāo)準(zhǔn)也因從宇航技術(shù)的特殊角度出發(fā)，規(guī)定偏嚴(yán)，這對于動物體發(fā)散塵、菌集中實驗動物房就不一定適用。
由于NASA標(biāo)準(zhǔn)的特殊性，實際上它不太適于用做地球上具有特定目的的微生物污染控制標(biāo)準(zhǔn)，而實驗動物房內(nèi)的微生物控制是具有特定目的的。實驗動物房是動物生活的場所。活動的動物，即使本身很潔凈，但對潔凈室而言仍是最大的污染源，而且，實驗動物房內(nèi)的塵、菌發(fā)生量隨機(jī)性大很難確定，其顆粒濃度和粒徑分布也是不穩(wěn)定的。實驗動物房空態(tài)時能達(dá)到NASA標(biāo)準(zhǔn)的高級別，但飼養(yǎng)動物時卻難于維持同一級別。而實驗動物房的潔凈度關(guān)鍵在于其動態(tài)，它決定于實驗動物的潔凈度，實驗要求的潔凈度及通過實驗損失的潔凈度。
（2）實驗動物房的運(yùn)行時間與其他生物潔凈室的不同。其他生物潔凈室，如手術(shù)室、制藥廠等，其室內(nèi)潔凈度只要求在某一時間段內(nèi)，如手術(shù)期間或生產(chǎn)藥品時，維持其所需水平。而實驗動物房的潔凈度通常是晝夜地、長期連續(xù)地維持其所需水平。因此，室內(nèi)不可能采用熏蒸等方式進(jìn)行較徹底的滅菌處理，只能使用不致影響實驗動物正常生活，而藥力相對較弱的藥劑擦洗。這就意味著，微生物一旦污染室內(nèi)就較難控制。因此，必須全面杜絕微生物的污染，長期保證室內(nèi)空氣質(zhì)量。
（3）除無菌動物和特殊菌動物養(yǎng)設(shè)施外，占潔凈動物飼養(yǎng)設(shè)施主流的無特殊病原體動物飼養(yǎng)設(shè)施的潔凈度要求相對較低。這主要因為:無特殊病原體的動物身上除指定病原體外，允許其他非病原性常在菌存在。而且有些常在菌是動物正常生命活動不可缺少的。因此空氣凈化技術(shù)只需除去有害動物健康，影響實驗結(jié)果的特定微生物群。所以無特殊病原體動物的飼養(yǎng)設(shè)施不一定要求很高的潔凈度。當(dāng)指定的病原體種類越多，飼養(yǎng)條件相對越嚴(yán)格。